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Academic Year/course: 2022/23

446 - Degree in Biotechnology

27117 - Molecular Biology


Syllabus Information

Academic Year:
2022/23
Subject:
27117 - Molecular Biology
Faculty / School:
100 - Facultad de Ciencias
Degree:
446 - Degree in Biotechnology
ECTS:
6.0
Year:
3
Semester:
First semester
Subject Type:
Compulsory
Module:
---

1. General information

1.3. Recommendations to take this course

As a mandatory subject, this course is based on previous knowledge adquired in the corses of Chemistry, Genetics, Cellular Biology and Biochemistry.

2. Learning goals

3. Assessment (1st and 2nd call)

3.1. Assessment tasks (description of tasks, marking system and assessment criteria)

 The final mark in this course will derive from:

a) a written and orally presented work (20% of the final vote) (see activities: "seminars").

b) a writtem exam (80% of the final vote) composed of multiple option questions (25% of this part) and 6-9 short (half a page maximum) open questions covering the main topics developed during the course (75 % of this part).

 

 

 

4. Methodology, learning tasks, syllabus and resources

4.1. Methodological overview

The methodology followed in this course is oriented towards the achievement of the learning objectives. A wide range of teaching and learning tasks are implemented, such as: Lectures, Seminars, autonomous work and study.

Students are expected to participate actively in class throughout the semester.

Further information regarding the course will be provided on the first day of class.

4.2. Learning tasks

The course includes the following learning tasks: 

  • Lectures (4 ECTS) to cover the program detailed in section  5.3. The basic resources to follow the teacher presentations will be provided through the University online platform.
  • Seminars (2 ECTS): In this activity students collect information on a particular topic, aided by the teacher through tutoring sessions. Finally, the works are presented and discussed in class by the student.

The final mark in this course will derive from:

  • a) a written and orally presented work ("seminars"; 20% of the final vote).
  • b) a written exam (80% of the final vote) composed of multiple option questions (25% of this part) and 6-9 short (half a page maximum) open questions covering the main topics developed during the theoretical lessons (75 % of this part).

 

  • Teaching and assessment activities will take place as usual in presential mode, unless, due to the health situation, the medical authorities and the University decide to recommend or impose on line teaching.

4.3. Syllabus

The course will address the following topics: 

  • Topic 1. Objectives of the course. Basic structural features of nucleic acids. Structure and organization of the prokaryotic and eukaryotic genomes.
  • Topic 2. DNA replication: basic features of DNA synthesis. ProkaryotIC DNA polymerases. Fidelity polymerases. Origin of replication. The replisomE.Regulation of replication initiation. Termination of replication.
  • Topic 3. Eukaryotic DNA replication. EukaryotIC DNA polymerases. Histone duplication. Telomeres and Telomerase.
  • Topic 4. Mitochondrial DNA replication.
  • Topic 5. Virus replication. DNA synthesis from RNA. Replicating RNA genomes.
  • Topic 6. DNA repair. Fidelity of replication. Mutations. Repair mechanisms in E. coli. SOS repair. Repair in eukaryotic organisms.
  • Topic 7. Prokaryotic RNA synthesis. Classes of RNAs. RNA synthesis mechanism. RNA polymerases. Promoter. Initiation, elongation and termination of RNA synthesis. Inhibitors of transcription.
  • Topic 8. Prokaryotic RNA processing. Maturation of tRNAs and rRNAs.
  • Topic 9. Synthesis of eukaryotic RNA. RNA polymerases. Promoters. Transcription factors. Synthesis of ribosomal, messengers and transfer RNAs. Expression regulation of various types of genes. Inhibitors of transcription.
  • Topic 10. Post-transcriptional modifications of RNA in eukaryotes. Exons and introns. Processing of ribosomal, messengers and transfer RNA precursors.
  • Topic 11. Mitochondrial RNA synthesis and processing. Organization and expression of the mitochondrial DNA of mammals and other animals. RNA processing. Organization and expression of the yeast mitochondrial DNA. Maturases.
  • Topic 12. Genetic code. Deciphering the genetic code. Codon-anticodon recognition. Codon usage. Redundancy of the genetic code. Mitochondrial genetic code. Alterations of the genetic code: mutations.
  • Topic 13. General ranslation characteristics.-  Protein synthesis machinery. Transfer RNA. Relationship between structure and function of tRNA. Aminoacylation. Aminoacyl tRNA synthetases. Structure of ribosomes. Ribosomes role in protein synthesis. Active centers of ribosomes.
  • Topic 14. Protein biosynthesis in procaryotes. Stages of initiation, elongation and termination: Requirements, factors and general translation mechanism. Polyribosomes.
  • Topic 15. Biosynthesis of proteins in eucaryotic cells.- Differential characteristics. Mitochondrial protein synthesis. Translation inhibitors.
  • Topic 16. Regulation of gene expression in prokaryotes. Regulation of initiation factors. Sporulation of Bacillus subtilis. Operon's positive and negative control. Lac operon. Trp operon. Regulation of the life cycle of bacteriophage l.
  • Topic 17. Regulation of gene expression in eucaryotic cells.- General features. Transcription factors. Cis regulatory sequences. Response elements. DNA binding domains. Zinc fingers. Homeotic genes. Leucine zippers. Dosage and gene amplification. Regulation of RNA processing. Regulation of translation. Post-translational regulation.

4.4. Course planning and calendar

This course is scheduled for the first semester of the academic year.

Schedules of lectures and problems will coincide with the officially established and will be available at: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

The places, calendar and groups for training and practical sessions will be established in coordination with the rest of maters at beginning of course. The Coordinator will produce the groups of students for these activities at beginning of course to avoid overlaps with other subjects.

For students enrolled in the subject, places, times and dates of lectures and practical sessions will be public via Bulletin Board advertisements of the grade on the platform Moodle at the University of Zaragoza, https://moodle2.unizar.es/add/, and in the moodle page for the course. These routes will be also used to communicate enrolled students their distribution by groups of practical sessions, which will be organized by the coordination of degree.  Provisional dates will be available on the website of the Faculty of Sciences in the corresponding section of the Degree in Biotechnology:https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

In this web there will be also available the dates of exams.

This course is scheduled for the first semester of the academic year. The precise planning of the lessons and exam dates can be found in the School web page at: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia

4.5. Bibliography and recommended resources

http://psfunizar10.unizar.es/br13/egAsignaturas.php?codigo=27117


Curso Académico: 2022/23

446 - Graduado en Biotecnología

27117 - Biología molecular


Información del Plan Docente

Año académico:
2022/23
Asignatura:
27117 - Biología molecular
Centro académico:
100 - Facultad de Ciencias
Titulación:
446 - Graduado en Biotecnología
Créditos:
6.0
Curso:
3
Periodo de impartición:
Primer semestre
Clase de asignatura:
Obligatoria
Materia:
---

1. Información Básica

1.1. Objetivos de la asignatura

La asignatura y sus resultados previstos responden a los siguientes planteamientos y objetivos:

Se pretende familiarizar al estudiante con las aplicaciones directas de los conocimientos aprendidos para que perciban los avances, controversias y retos que el progreso de la investigación en Biología Molecular proporciona. Este objetivo se adquirirá a través de clases teóricas y de los seminarios. Con la elaboración de un trabajo personal se pretende que los alumnos profundicen los conocimientos previos y adquieran competencias adicionales relacionadas con la búsqueda de información y su análisis crítico, redacción y comunicación de contenidos científicos, etc.

Estos planteamientos y objetivos están alineados con los siguientes Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS) de la Agenda 2030 de Naciones Unidas (https://www.un.org/sustainabledevelopment/es/), de tal manera que la adquisición de los resultados de aprendizaje de la asignatura proporciona capacitación y competencia para contribuir en cierta medida a su logro: Objetivo 3: Salud y bienestar; Objetivo 4: Educación de calidad; Objetivo 5: Igualdad de género; Objetivo 6: Agua limpia y saneamiento; Objetivo 7: Energía asequible y no contaminante; Objetivo 8: Trabajo decente y crecimiento económico; Objetivo 9: Industria, innovación e infraestructuras; Objetivo 10: Reducción de las desigualdades; Objetivo 11: Ciudades y comunidades sostenibles; Objetivo 12: Producción y consumo responsables; Objetivo 13: Acción por el clima; Objetivo 14: Vida submarina; Objetivo 15: Vida de ecosistemas terrestres.

1.2. Contexto y sentido de la asignatura en la titulación

Esta asignatura, como integrante del grado en Biotecnología, se ofrece a sus estudiantes para proporcionar los conocimientos sobre las estructuras y los procesos moleculares que hacen posible la síntesis de macromoléculas (ácidos nucleicos y proteínas), que le permitan abordar los aspectos básicos de su regulación en el contexto que rodea las investigaciones con aplicación directa en biotecnología y su importancia para el funcionamiento de los seres vivos.

1.3. Recomendaciones para cursar la asignatura

Como asignatura obligatoria del grado en Biotecnología se sustenta en los conocimientos adquiridos en las asignaturas de Química, Genética, Biología Celular y Bioquímica.

2. Competencias y resultados de aprendizaje

2.1. Competencias

Al superar la asignatura, el estudiante será más competente para...

Conocer los mecanismos moleculares implicados en la síntesis de macromoléculas (ácidos nucleicos y proteínas) y su regulación para el funcionamiento de los seres vivos.

Conocer y ser capaz de aplicar las técnicas empleadas en biología molecular

Utilizar la terminología básica de las enzimas implicadas en la síntesis de ácidos nucleicos y proteínas.

Buscar y analizar información específica relacionada con la Biología Molecular, así como valorar la relevancia de los avances del campo

Resolver problemas de Biología Molecular, así como integrar los resultados

Además de estas competencias específicas, el alumno ha de mejorar:

1) La capacidad de observación.

2) La capacidad para resolver los problemas concretos.

3) El análisis crítico de la información.

4) La síntesis e integración de la información.

5) La presentación pública de temas.

2.2. Resultados de aprendizaje

El estudiante, para superar esta asignatura, deberá demostrar los siguientes resultados...

Conocer las estructuras y los procesos moleculares que hacen posible la síntesis de macromoléculas (ácidos nucleicos y proteínas) y su regulación para el funcionamiento de los seres vivos.

Valorar la relevancia de los avances del campo y la capacidad de resolución de problemas

Utilizar la terminología básica de las enzimas implicadas en la síntesis de ácidos nucleicos y proteínas.

Comprender la base molecular de la integración en la biosíntesis de macromoléculas.

Enfrentarse a la observación y a la integración de los resultados.

Búsqueda, análisis de información específica y transmisión de aspectos de la asignatura.

Explicar y argumentar adecuadamente los fundamentos de los diversos aspectos que conforman la asignatura

Presentar y exponer trabajos realizados de forma individual

2.3. Importancia de los resultados de aprendizaje

Todo el trabajo esta encaminado a familiarizar al estudiante con los aspectos descritos. Esta disciplina consiste en acercar al estudiante al contexto de la biología molecular, de su aplicación en biotecnología. En su desarrollo serán fundamentales las aproximaciones experimentales de gran escala mediante las pertinentes metodologías, conferencias por científicos, avances y seminarios, entre otros. Se trata de actividades que se programarán a lo largo del curso y también en coordinación con el Centro.

3. Evaluación

3.1. Tipo de pruebas y su valor sobre la nota final y criterios de evaluación para cada prueba

El estudiante deberá demostrar que ha alcanzado los resultados de aprendizaje previstos mediante las siguientes actividades de evaluacion

El estudiante deberá demostrar que ha alcanzado los resultados de aprendizaje previstos mediante las siguientes actividades de evaluación. Para superar esta asignatura, el estudiante deberá alcanzar una puntuación global mínima de 5 puntos sobre un total de 10.

Se adoptarán los criterios que se describen a continuación, con su nivel de exigencia.

 

Presentación y exposición de un trabajo individual:

Los trabajos versarán sobre una temática relacionada con la asignatura, que cada alumno concretará con el profesor. El profesor supervisará el trabajo personal del alumno, guiándole en la búsqueda de información y en su valoración. El trabajo deberá presentarse por escrito y posteriormente, presentado y debatido en clase.

Criterios de valoración y niveles de exigencia: La realización de un trabajo escrito y su presentación ante la clase será obligatoria para superar la asignatura. Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 20% a la calificación final. Los criterios de valoración son los siguientes:

  • Coherencia de la información
  • Claridad en la exposición
  • Grado de elaboración de la presentación.
  • Grado de interiorización de los contenidos con sugerencias propias.

 

Realización de una prueba objetiva

Las competencias específicas se evaluarán mediante pruebas escritas consistentes en pruebas test y de ensayo.

La asimilación y dominio de las competencias específicas se verificarán con 25 preguntas de test de 5 respuestas cada una (respuesta única verdadera). Las respuestas incorrectas no descontarán puntuación. La prueba objetiva contará además con preguntas de desarrollo corto (de 6 a 9). Las preguntas tipo test y las preguntas cortas se evaluarán sobre 25 puntos y 75 puntos sobre 100, respectivamente. Se puntuará de 0 a 10 y contribuirá en un 80% a la calificación final.

Será necesario obtener un mínimo de un 5 sobre 10 en la prueba objetiva para poder aprobar la asigantura (siempre que con la nota del trabajo individual se supere la media de 5/10).

La prueba consistirá en una serie de preguntas sobre los contenidos teóricos de la asignatura.

 

El fraude o plagio total o parcial en cualquiera de las pruebas de evaluación dará lugar al suspenso de la asignatura con la mínima nota, además de las sanciones disciplinarias que la comisión de garantías adopte para estos casos.

 

Pruebas para estudiantes que se presenten en otras convocatorias distintas de la primera.

Para aquellos estudiantes que tengan que presentarse en sucesivas convocatorias por no haber superado la asignatura en primera convocatoria, la evaluación consistirá en las mismas pruebas que para los estudiantes de primera convocatoria, con las siguientes particularidades:

  1. Aquellos estudiantes que en las convocatorias anteriores hayan obtenido al menos 5 puntos en la presentación y exposición de un trabajo individual no tendrán la obligación de presentar un nuevo trabajo.

Además de la modalidad de evaluación señalada en los puntos anteriores, el alumno tendrá la posibilidad de ser evaluado en una prueba global, que juzgará la consecución de los resultados del aprendizaje señalados anteriormente.

El temario que los estudiantes deben utilizar para preparar las diferentes pruebas se encuentra en el apartado "Actividades y recursos" de esta misma guía docente

4. Metodología, actividades de aprendizaje, programa y recursos

4.1. Presentación metodológica general

El proceso de aprendizaje que se ha diseñado para esta asignatura se basa en lo siguiente:

En las clases teóricas se presentarán a los alumnos los conocimientos teóricos básicos de la asignatura, que versarán sobre los aspectos mencionados en los distintos temas del programa. Además, esta asignatura contempla una intensificación de conocimientos teóricos con participación activa del estudiante. Esta estrategia permitirá que el alumno revise un tema en estrecho contacto con un destacado profesional que le acercará a tareas de búsqueda de información, síntesis de la misma e investigación lo que puede facilitarle un posterior desarrollo profesional.

4.2. Actividades de aprendizaje

El programa que se ofrece al estudiante para ayudarle a lograr los resultados previstos comprende las siguientes actividades...


Clases teóricas. 4 ECTS. En ellas se presentan a los alumnos los conocimientos teóricos básicos de la asignatura, que versarán sobre los aspectos mencionados en el programa (sección 5.3.).

Presentación y exposición de un trabajo. 2 ECTS. Esta actividad consiste en que los alumnos recopilarán información sobre un tema concreto, ayudados por el profesor. El profesor supervisará en todo momento el trabajo individual de los alumnos mediante la programación de sesiones de tutorías. Finalmente, los trabajos se expondrán y debatirán en clase.

 

Todo alumno será informado sobre los riesgos que puede tener la realización de las prácticas de esta asignatura, así como si se manejan productos peligrosos y qué hacer en caso de accidente, y deberá firmar el compromiso a cumplir con las normas de trabajo y seguridad para poder  realizarlas. Para más información, consultar la información para estudiantes de la Unidad de Prevención de Riesgos Laborales: http://uprl.unizar.es/estudiantes.html.

Las actividades docentes y de evaluación se llevarán a cabo de modo presencial salvo que, debido a la situación sanitaria, las disposiciones emitidas por las autoridades competentes y por la Universidad de Zaragoza obliguen a realizarlas de forma telemática o semi-telemática con aforos reducidos o rotatorios.

 

 

4.3. Programa

El programa de la asignatura se desglosa en los siguientes 17 temas:

 

1. Objetivos de la asignatura. Características estructurales básicas de los ácidos nucleicos. Estructura y organización de los genomas de procariotas y de eucariotas.
2. La replicación del DNA: caracteres básicos de la síntesis de DNA. Replicación semiconservativa, bidireccional y ligada al ciclo celular. DNA polimerasas de procariotas. Fidelidad de las polimerasas. Origen de replicación. El replisoma. Terminación de la replicación. Regulación de la iniciación de la replicación.
3. Replicación del DNA de eucariotas. DNA polimerasas de eucariotas. Duplicación de Histonas. Telómeros y Telomerasas.
4. Replicación del DNA mitocondrial.
5. Replicación de virus. Síntesis de DNA a partir de RNA. Replicación de genomas de RNA.
6. Reparación del DNA. Fidelidad de la replicación. Mutaciones. Mecanismos de reparación en E. coli. Reparación SOS. Reparación en organismos eucariotas.
7. Síntesis de RNA de procariotas. Clases de RNAs. Mecanismo de síntesis de RNA. RNA polimerasas. Promotor. Iniciación, alargamiento y terminación de la síntesis de RNA. Inhibidores de la transcripción.
8. Procesamiento de RNA de procariotas. Maduración de tRNAs y rRNAs.
9. Síntesis de RNA de eucariotas. RNA polimerasas. Promotores. Factores de transcripción. Síntesis de RNAs ribosómicos, mensajeros y de transferencia. Regulación de la expresión de los distintos tipos de genes. Inhibidores de la transcripción.
10. Modificaciones post-transcripcionales del RNA de eucariotas. Intrones y exones. Procesamiento de precursores de RNA ribosómicos, mensajeros y de transferencia.
11. Sintesis y procesamiento de RNA mitocondrial. Organización y expresión del DNA mitocondrial de mamíferos y de otros animales. Procesamiento de RNA. Organización y expresión del DNA mitocondrial de levadura. Maturasas.
12.Código genético. Desciframiento de código genético. Reconocimiento codon-anticodon. Uso de codones. Redundancia del código genético. Hipótesis del balanceo. Código genético de mitocondrias. Alteraciones del código genético: mutaciones.
13. La maquinaria de traducción.- Caracteres generales de la síntesis de proteínas. RNA de transferencia. Relación entre estructura y función del tRNA. Unión de los aminoácidos al tRNA. Aminoacil tRNA sintetasas. Estructura de los ribosomas. Papel de los ribosomas en la síntesis de proteínas. Centros activos de los ribosomas.
14. Biosíntesis de proteínas en procariotas.- Dirección de la síntesis de proteínas. Etapas de iniciación, alargamiento y terminación: Requisitos, factores, mecanismo de traducción. Polirribosomas.
15. Biosíntesis de proteínas en eucariotas.- Características diferenciales. Síntesis de proteínas mitocondriales. Inhibidores de la traducción.
16. Regulación de la expresión génica en procariotas. Regulación de la iniciación por factores. Esporulación de Bacillus subtilis. Operones de control positivo y negativo. Operón Lac. Operón Trp.
17. Regulación de la expresión génica en eucariotas.- Caracteres generales. Factores de transcripción. Secuencias reguladoras cis. Elementos respuesta. Dominios de unión al DNA. Dedos de Zinc. Genes homeoticos. Cremalleras de leucina. Dosificación y amplificación de genes. Regulación del procesamiento del RNA. Regulación de la traducción. Regulación post-traduccional.

4.4. Planificación de las actividades de aprendizaje y calendario de fechas clave

El periodo de clases teóricas y de problemas coincidirá con el establecido oficialmente. Consultar en: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

El calendario y los grupos de prácticas se establecerán de manera coordinada con el resto de materias a principio de curso. El coordinador confeccionará los grupos de prácticas a principio de curso con el objeto de no producir solapamientos con otras asignaturas.

La asignatura es cuatrimestral y se imparte en el primer cuatrimestre.

Para aquellos alumnos matriculados los horarios y fechas de clases teóricas y sesiones prácticas se harán públicos a través del TABLON DE ANUNCIOS DEL GRADO en moodle y en el moodle de la asignatura. Dichas vías serán también utilizadas para comunicar a los alumnos matriculados su distribución por grupos de prácticas confeccionada desde la Coordinación del Grado.

Unas fechas provisionales se podrán consultar en la página web de la Facultad de Ciencias en la sección correspondiente del Grado en Biotecnología: https://ciencias.unizar.es/grado-en-biotecnologia.

En dicha web se podrán consultar también las fechas de exámenes en el apartado Grado en Biotecnología.

 

4.5. Bibliografía y recursos recomendados

http://psfunizar10.unizar.es/br13/egAsignaturas.php?codigo=27117